福建医科大学创建于1937年，是我国建校较早的公立本科医学院校之一，是一所以医为主，多学科协调发展，具有完整人才培养体系的福建省“双一流”建设高校，是福建省人民政府和国家卫生健康委员会共建高校，是福建省卫生人才培养中心、医学科学研究中心和医疗卫生服务中心，学校综合实力位于全国同类医学院校先进行列。

学校现有旗山、乌山2个校区，规划占地约1550亩，有教职医护员工14700多人（含附属医院），在校全日制学生18000多人。专任教师（含临床教师）1664人，其中具有博士学位教师超57.09%，具有高级职称教师占68.63%。拥有国家级高层次人才53人次、“南丁格尔”奖章获得者2人；有国家级特色专业4个，国家级一流本科专业建设点11个；有博士学位授权一级学科6个、博士专业学位授权点2个、硕士学位授权一级学科9个、硕士专业学位授权点9个；有临床医学和基础医学博士后科研流动站2个，博士后工作站4个，院士工作站2个。临床医学、药理学与毒理学、化学、神经科学与行为学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学等6个学科进入ESI全球排名前1%。现有临床医学、基础医学等省级一流学科6个。

学校拥有附属协和医院、附属第一医院、附属第二医院、附属口腔医院4所直属附属医院，7所临床医学院。附属医院中拥有神经内科、血液内科、心脏大血管外科、普通外科等国家临床重点专科21个。附属协和医院、附属第一医院是福建省首批建设的高水平医院，均进入复旦大学医院管理研究所“中国医院百强排行榜”。

福建医科大学是中国教育部公布的具有资质招收临床医学专业本科(英语授课)留学生的院校之一，自2009年9月起正式招生。学生来自印度、孟加拉国、毛里求斯、巴基斯坦、泰国、肯尼亚、索马里、伊朗、赞比亚、美国等50多个国家，共招收培养了700多名留学生。